Η Ειρήνη Αγαπηδάκη είναι Ψυχολόγος, κάτοχος Μεταπτυχιακού Διπλώματος Ειδίκευσης (MSc) στην Προαγωγή και Αγωγή Υγείας από την Ιατρική Σχολή του Εθνικού και Καποδιστριακού Πανεπιστημίου Αθηνών (ΕΚΠΑ) και Διδακτορικού Διπλώματος (PhD) στην Ψυχολογία Υγείας. Έχει επίσης εξειδικευτεί σε θέματα πρόληψης των ψυχικών διαταραχών και προαγωγής της ψυχικής υγείας. Επιπλέον, διαθέτει πολυετή διδακτική και ερευνητική εμπειρία στους τομείς της πολιτικής δημόσιας υγείας, της μεθοδολογίας έρευνας στη δημόσια υγεία και της προαγωγής της ψυχικής υγείας – στο πλαίσιο εθνικών, ευρωπαϊκών και διεθνών ερευνητικών προγραμμάτων. Έχει εργαστεί για πολλά χρόνια ως επιστημονική συνεργάτιδα στο Εργαστήριο Υγιεινής, Επιδημιολογίας και Ιατρικής Στατιστικής της Ιατρικής Σχολής του ΕΚΠΑ. Επίσης, εξελέγη και υπηρέτησε ως Λέκτορας Δημόσιας Υγείας στην Ιατρική Σχολή του Ευρωπαϊκού Πανεπιστημίου Κύπρου. Το 2019 παραιτήθηκε από τα ακαδημαϊκά της καθήκοντα προκειμένου να αναλάβει τη θέση της Ειδικής Γραμματέως Προστασίας Ασυνόδευτων Ανήλικων. Στα τέλη Δεκεμβρίου του 2021 ανέλαβε καθήκοντα Γενικής Γραμματέως Δημόσιας Υγείας, ενώ από τον Ιούλιο του 2023 υπηρετεί ως Αναπληρώτρια Υπουργός Υγείας και ως μέλος του Ελληνικού Κοινοβουλίου (Βουλευτής).